Análisis genómico de cepas clínicas de K. pneumoniae procedentes de establecimientos de salud de Lima y Piura

TESIS
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Date
2025Author(s)
Villavicencio Hidalgo, Adriana Sofia
Delgado Mosqueira, Jose Leonardo
Metadata
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La resistencia antimicrobiana (RAM) en Klebsiella pneumoniae representa un desafío emergente para la salud pública global, dada su capacidad para adquirir y diseminar determinantes genéticos mediante elementos móviles. Este estudio aborda la caracterización genómica de siete cepas clínicas de K. pneumoniae recolectadas en centros de salud ubicados en Lima y Piura, Perú, mediante la secuenciación completa del genoma (SCG) y el uso de herramientas bioinformáticas. Las cepas analizadas mostraron un tamaño genómicoentre 5.50 y 5.79 Mb, con un promedio de 5,455 secuencias codificantes (CDS). La tipificación multilocus (MLST) permitió identificar linajes como ST15, asociado a brotes nosocomiales de alto riesgo, y ST147, conocido por su capacidad de diseminación internacional. El análisis estructural de loci capsulares (KL) y de lipopolisacáridos (O) reveló la preponderancia del serotipo O1ab y una diversidad en los loci KL, destacando KL24 y KL64 como los más comunes. El perfil de resistencia estuvo asociado a genes prioritarios como blaNDM y blaKPC, vinculados a carbapenémicos y beta-lactámicos respectivamente, además de blaCTX-M, blaOXA-48 y blaTEM, reflejando una resistencia cruzada mediada por plásmidos conjugativos. Las cepas estudiadas se agruparon en dos clados principales, con una divergencia evolutiva temprana de la cepa AUNA64, posiblemente relacionada con su origen clínico específico. Los resultados evidencian la importancia de los datos de la vigilancia genómica, proporcionando una base sólida para el desarrollo de políticas antimicrobianas fundamentadas en evidencia científica.
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